RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591254.1

TRIR-204, Transcript of telomerase RNA component interacting RNase, humanhuman

TSL 2

Gene TRIR, Length 988 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIR-204ENST00000591254 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.1■■■■■ 7.85
TRIR-204ENST00000591254 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.5■■■■■ 6.79
TRIR-204ENST00000591254 ABCC9O60706 1549 aa57.12■■■■■ 6.73
TRIR-204ENST00000591254 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.48■■■■■ 6.31
TRIR-204ENST00000591254 NACADO15069 1562 aa54.15■■■■■ 6.26
TRIR-204ENST00000591254 DCAF8L2P0C7V8 631 aa53.9■■■■■ 6.22
TRIR-204ENST00000591254 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.55■■■■■ 6.16
TRIR-204ENST00000591254 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.44■■■■■ 6.15
TRIR-204ENST00000591254 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.23■■■■■ 6.11
TRIR-204ENST00000591254 DNAJC5BQ9UF47 199 aa53.22■■■■■ 6.11
TRIR-204ENST00000591254 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.16■■■■■ 6.1
TRIR-204ENST00000591254 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.97■■■■■ 6.07
TRIR-204ENST00000591254 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa52.91■■■■■ 6.06
TRIR-204ENST00000591254 SCRIBQ14160 1630 aa52.45■■■■■ 5.99
TRIR-204ENST00000591254 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.1■■■■■ 5.93
TRIR-204ENST00000591254 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa51.67■■■■■ 5.86
TRIR-204ENST00000591254 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.6■■■■■ 5.85
TRIR-204ENST00000591254 CECR2Q9BXF3 1484 aa51.36■■■■■ 5.81
TRIR-204ENST00000591254 SMARCA4P51532 1647 aa50.03■■■■■ 5.6
TRIR-204ENST00000591254 NCAPD3P42695 1498 aa49.93■■■■■ 5.58
TRIR-204ENST00000591254 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa49.88■■■■■ 5.58
TRIR-204ENST00000591254 SMARCA2P51531 1590 aa49.77■■■■■ 5.56
TRIR-204ENST00000591254 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.74■■■■■ 5.55
TRIR-204ENST00000591254 HMGXB3Q12766 1538 aa49.68■■■■■ 5.54
TRIR-204ENST00000591254 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.47■■■■■ 5.51
TRIR-204ENST00000591254 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.45■■■■■ 5.51
TRIR-204ENST00000591254 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.44■■■■■ 5.5
TRIR-204ENST00000591254 ERCC6Q03468 1493 aa49.24■■■■■ 5.47
TRIR-204ENST00000591254 NESP48681 1621 aa49.2■■■■■ 5.47
TRIR-204ENST00000591254 CUX2O14529 1486 aa48.99■■■■■ 5.43
TRIR-204ENST00000591254 WIZO95785 1651 aa48.98■■■■■ 5.43
TRIR-204ENST00000591254 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.85■■■■■ 5.41
TRIR-204ENST00000591254 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.72■■■■■ 5.39
TRIR-204ENST00000591254 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.69■■■■■ 5.39
TRIR-204ENST00000591254 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa48.51■■■■■ 5.36
TRIR-204ENST00000591254 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.47■■■■■ 5.35
TRIR-204ENST00000591254 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.43■■■■■ 5.34
TRIR-204ENST00000591254 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.41■■■■■ 5.34
TRIR-204ENST00000591254 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.27■■■■■ 5.32
TRIR-204ENST00000591254 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.1■■■■■ 5.29
TRIR-204ENST00000591254 WDR62O43379 1518 aa48.01■■■■■ 5.28
TRIR-204ENST00000591254 CFTRP13569 1480 aa47.97■■■■■ 5.27
TRIR-204ENST00000591254 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.97■■■■■ 5.27
TRIR-204ENST00000591254 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.95■■■■■ 5.27
TRIR-204ENST00000591254 PRDM2Q13029 1718 aa47.82■■■■■ 5.25
TRIR-204ENST00000591254 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.69■■■■■ 5.22
TRIR-204ENST00000591254 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.59■■■■■ 5.21
TRIR-204ENST00000591254 TOPBP1Q92547 1522 aa47.11■■■■■ 5.13
TRIR-204ENST00000591254 DNMBPQ6XZF7 1577 aa46.98■■■■■ 5.11
TRIR-204ENST00000591254 IFT140Q96RY7 1462 aa46.95■■■■■ 5.11
TRIR-204ENST00000591254 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.95■■■■■ 5.11
TRIR-204ENST00000591254 ABCC8Q09428 1581 aa46.9■■■■■ 5.1
TRIR-204ENST00000591254 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP46.78■■■■■ 5.08
TRIR-204ENST00000591254 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.73■■■■■ 5.07
TRIR-204ENST00000591254 OSCARQ8IYS5 282 aa46.71■■■■■ 5.07
TRIR-204ENST00000591254 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.64■■■■■ 5.06
TRIR-204ENST00000591254 TRIM41Q8WV44 630 aa46.63■■■■■ 5.06
TRIR-204ENST00000591254 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.57■■■■■ 5.05
TRIR-204ENST00000591254 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.52■■■■■ 5.042e-6■■□□□ 13.2
TRIR-204ENST00000591254 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.5■■■■■ 5.03
TRIR-204ENST00000591254 CHD1O14646 1710 aa46.47■■■■■ 5.03
TRIR-204ENST00000591254 CUX1P39880 1505 aa46.45■■■■■ 5.03
TRIR-204ENST00000591254 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.42■■■■■ 5.02
TRIR-204ENST00000591254 SOGA1O94964 1423 aa46.36■■■■■ 5.01
TRIR-204ENST00000591254 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.34■■■■■ 5.01
TRIR-204ENST00000591254 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.34■■■■■ 5.01
TRIR-204ENST00000591254 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.34■■■■■ 5.01
TRIR-204ENST00000591254 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.25■■■■■ 4.99
TRIR-204ENST00000591254 WDR97A6NE52 1622 aa46.22■■■■■ 4.99
TRIR-204ENST00000591254 ARHGEF11O15085 1522 aa46.15■■■■■ 4.98
TRIR-204ENST00000591254 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.09■■■■■ 4.97
TRIR-204ENST00000591254 FBLN2P98095 1184 aa46.08■■■■■ 4.97
TRIR-204ENST00000591254 PBRM1Q86U86 1689 aa46.03■■■■■ 4.96
TRIR-204ENST00000591254 GRIN2BQ13224 1484 aa45.93■■■■■ 4.94
TRIR-204ENST00000591254 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP45.92■■■■■ 4.94
TRIR-204ENST00000591254 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.88■■■■■ 4.94
TRIR-204ENST00000591254 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.86■■■■■ 4.93
TRIR-204ENST00000591254 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa45.86■■■■■ 4.93
TRIR-204ENST00000591254 GAPVD1Q14C86 1478 aa45.85■■■■■ 4.93
TRIR-204ENST00000591254 SYNJ1O43426 1573 aa45.81■■■■■ 4.92
TRIR-204ENST00000591254 TOP2BQ02880 1626 aa45.8■■■■■ 4.92
TRIR-204ENST00000591254 CLASP1Q7Z460 1538 aa45.79■■■■■ 4.92
TRIR-204ENST00000591254 SYNJ2O15056 1496 aa45.76■■■■■ 4.92
TRIR-204ENST00000591254 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP45.75■■■■■ 4.91
TRIR-204ENST00000591254 ARAP1Q96P48 1450 aa45.72■■■■■ 4.91
TRIR-204ENST00000591254 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.71■■■■■ 4.91
TRIR-204ENST00000591254 CYB5RLQ6IPT4 315 aa45.67■■■■■ 4.9
TRIR-204ENST00000591254 ADAMTS12P58397 1594 aa45.51■■■■■ 4.88
TRIR-204ENST00000591254 GRIN2AQ12879 1464 aa45.4■■■■■ 4.86
TRIR-204ENST00000591254 CEP170Q5SW79 1584 aa45.31■■■■■ 4.84
TRIR-204ENST00000591254 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.29■■■■■ 4.84
TRIR-204ENST00000591254 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.23■■■■■ 4.83
TRIR-204ENST00000591254 NUP160Q12769 1436 aa45.19■■■■■ 4.83
TRIR-204ENST00000591254 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.18■■■■■ 4.82
TRIR-204ENST00000591254 SHROOM2Q13796 1616 aa45.08■■■■■ 4.81
TRIR-204ENST00000591254 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.06■■■■■ 4.8
TRIR-204ENST00000591254 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.86■■■■■ 4.77
TRIR-204ENST00000591254 CUL7Q14999 1698 aa44.79■■■■■ 4.76
TRIR-204ENST00000591254 KIF27Q86VH2 1401 aa44.78■■■■■ 4.76
TRIR-204ENST00000591254 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP44.73■■■■■ 4.75
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