Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SPRYD3Q8NCJ5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms