Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SEC24CP53992 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms