Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
THSD1Q9NS62 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms