Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SPRYD3Q8NCJ5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms