Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
KRTAP25-1Q3LHN0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms