Protein–RNA interactions for Protein: P23508

MCC, Colorectal mutant cancer protein, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCP23508 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCCP23508 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCCP23508 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCCP23508 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCCP23508 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCP23508 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCP23508 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCP23508 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCP23508 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCP23508 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCP23508 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCP23508 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCP23508 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCP23508 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCCP23508 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms