Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCSO14618 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCSO14618 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCSO14618 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCSO14618 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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