Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P8

SIT1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIT1Q9Y3P8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SIT1Q9Y3P8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SIT1Q9Y3P8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SIT1Q9Y3P8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SIT1Q9Y3P8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SIT1Q9Y3P8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms