Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BTRCQ9Y297 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BTRCQ9Y297 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BTRCQ9Y297 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BTRCQ9Y297 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms