Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y215

COLQ, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLQQ9Y215 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COLQQ9Y215 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
COLQQ9Y215 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
COLQQ9Y215 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
COLQQ9Y215 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COLQQ9Y215 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COLQQ9Y215 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms