Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRQQ9UMZ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTPRQQ9UMZ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRQQ9UMZ3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRQQ9UMZ3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PTPRQQ9UMZ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.4 ms