Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL0

RCOR1, REST corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCOR1Q9UKL0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RCOR1Q9UKL0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RCOR1Q9UKL0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
RCOR1Q9UKL0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCOR1Q9UKL0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RCOR1Q9UKL0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCOR1Q9UKL0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RCOR1Q9UKL0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms