Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GMEB2Q9UKD1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GMEB2Q9UKD1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GMEB2Q9UKD1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GMEB2Q9UKD1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GMEB2Q9UKD1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GMEB2Q9UKD1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GMEB2Q9UKD1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms