Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJA3

MCM8, DNA helicase MCM8, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM8Q9UJA3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MCM8Q9UJA3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MCM8Q9UJA3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MCM8Q9UJA3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MCM8Q9UJA3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MCM8Q9UJA3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms