Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TFIP11Q9UBB9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TFIP11Q9UBB9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TFIP11Q9UBB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
TFIP11Q9UBB9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TFIP11Q9UBB9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms