Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PCDH10Q9P2E7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDH10Q9P2E7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDH10Q9P2E7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDH10Q9P2E7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDH10Q9P2E7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms