Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NECAP2Q9NVZ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NECAP2Q9NVZ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NECAP2Q9NVZ3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NECAP2Q9NVZ3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms