Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
GPHNQ9NQX3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GPHNQ9NQX3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GPHNQ9NQX3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
GPHNQ9NQX3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GPHNQ9NQX3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms