Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ34

TMEM9B, Transmembrane protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9BQ9NQ34 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM9BQ9NQ34 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM9BQ9NQ34 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM9BQ9NQ34 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM9BQ9NQ34 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM9BQ9NQ34 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM9BQ9NQ34 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM9BQ9NQ34 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM9BQ9NQ34 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM9BQ9NQ34 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM9BQ9NQ34 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM9BQ9NQ34 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM9BQ9NQ34 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM9BQ9NQ34 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms