Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SRA1Q9HD15 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SRA1Q9HD15 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SRA1Q9HD15 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SRA1Q9HD15 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms