Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VIPAS39Q9H9C1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VIPAS39Q9H9C1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
VIPAS39Q9H9C1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VIPAS39Q9H9C1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VIPAS39Q9H9C1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms