Protein–RNA interactions for Protein: Q9H204

MED28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28Q9H204 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MED28Q9H204 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MED28Q9H204 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MED28Q9H204 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MED28Q9H204 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MED28Q9H204 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms