Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E3

SAP130, Histone deacetylase complex subunit SAP130, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP130Q9H0E3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAP130Q9H0E3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAP130Q9H0E3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SAP130Q9H0E3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAP130Q9H0E3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SAP130Q9H0E3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SAP130Q9H0E3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SAP130Q9H0E3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SAP130Q9H0E3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SAP130Q9H0E3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms