Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NLRP1Q9C000 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.34■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
NLRP1Q9C000 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NLRP1Q9C000 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.26■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
NLRP1Q9C000 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.13■■■■□ 3.54
NLRP1Q9C000 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.07■■■■□ 3.53
NLRP1Q9C000 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.07■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NLRP1Q9C000 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms