Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXR3

ERVK-6, Endogenous retrovirus group K member 6 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-6Q9BXR3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVK-6Q9BXR3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVK-6Q9BXR3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ERVK-6Q9BXR3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ERVK-6Q9BXR3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ERVK-6Q9BXR3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVK-6Q9BXR3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVK-6Q9BXR3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms