Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWX1

PHF7, PHD finger protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF7Q9BWX1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PHF7Q9BWX1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PHF7Q9BWX1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHF7Q9BWX1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PHF7Q9BWX1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PHF7Q9BWX1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF7Q9BWX1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PHF7Q9BWX1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms