Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF12Q99081 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF12Q99081 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TCF12Q99081 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TCF12Q99081 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TCF12Q99081 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TCF12Q99081 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCF12Q99081 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCF12Q99081 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.8 ms