Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ4

MSLNL, Mesothelin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNLQ96KJ4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MSLNLQ96KJ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MSLNLQ96KJ4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MSLNLQ96KJ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MSLNLQ96KJ4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
MSLNLQ96KJ4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
MSLNLQ96KJ4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSLNLQ96KJ4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSLNLQ96KJ4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSLNLQ96KJ4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
MSLNLQ96KJ4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSLNLQ96KJ4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MSLNLQ96KJ4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSLNLQ96KJ4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSLNLQ96KJ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
MSLNLQ96KJ4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MSLNLQ96KJ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.2 ms