Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VPS50Q96JG6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VPS50Q96JG6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VPS50Q96JG6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
VPS50Q96JG6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms