Protein–RNA interactions for Protein: Q96D42

HAVCR1, Hepatitis A virus cellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAVCR1Q96D42 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HAVCR1Q96D42 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HAVCR1Q96D42 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HAVCR1Q96D42 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HAVCR1Q96D42 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms