Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNRQ92752 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNRQ92752 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNRQ92752 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
TNRQ92752 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TNRQ92752 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
TNRQ92752 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TNRQ92752 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
TNRQ92752 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
TNRQ92752 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
TNRQ92752 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
TNRQ92752 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
TNRQ92752 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TNRQ92752 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
TNRQ92752 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
TNRQ92752 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
TNRQ92752 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
TNRQ92752 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
TNRQ92752 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
TNRQ92752 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TNRQ92752 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
TNRQ92752 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TNRQ92752 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
TNRQ92752 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.49■■■■□ 3.59
TNRQ92752 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TNRQ92752 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TNRQ92752 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
TNRQ92752 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
TNRQ92752 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TNRQ92752 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
TNRQ92752 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TNRQ92752 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
TNRQ92752 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TNRQ92752 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
TNRQ92752 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
TNRQ92752 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
TNRQ92752 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TNRQ92752 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
TNRQ92752 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
TNRQ92752 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
TNRQ92752 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TNRQ92752 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
TNRQ92752 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.42■■■■□ 3.58
TNRQ92752 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
TNRQ92752 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TNRQ92752 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
TNRQ92752 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNRQ92752 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
TNRQ92752 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TNRQ92752 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
TNRQ92752 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
TNRQ92752 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.58
TNRQ92752 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
TNRQ92752 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TNRQ92752 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
TNRQ92752 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TNRQ92752 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNRQ92752 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TNRQ92752 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
TNRQ92752 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNRQ92752 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
TNRQ92752 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
TNRQ92752 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
TNRQ92752 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
TNRQ92752 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
TNRQ92752 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
TNRQ92752 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.32■■■■□ 3.56
TNRQ92752 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
TNRQ92752 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
TNRQ92752 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TNRQ92752 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TNRQ92752 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TNRQ92752 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
TNRQ92752 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
TNRQ92752 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TNRQ92752 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TNRQ92752 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TNRQ92752 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
TNRQ92752 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
TNRQ92752 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.56
TNRQ92752 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TNRQ92752 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TNRQ92752 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TNRQ92752 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.55
TNRQ92752 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TNRQ92752 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TNRQ92752 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TNRQ92752 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
TNRQ92752 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TNRQ92752 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TNRQ92752 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TNRQ92752 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
TNRQ92752 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TNRQ92752 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TNRQ92752 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
TNRQ92752 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNRQ92752 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.21■■■■□ 3.55
TNRQ92752 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TNRQ92752 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TNRQ92752 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms