Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVJ9

TWIST2, Twist-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST2Q8WVJ9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TWIST2Q8WVJ9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TWIST2Q8WVJ9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
TWIST2Q8WVJ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TWIST2Q8WVJ9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TWIST2Q8WVJ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms