Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU6

PREX1, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREX1Q8TCU6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
PREX1Q8TCU6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC38■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC38■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.99■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PREX1Q8TCU6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.66
PREX1Q8TCU6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.85■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
PREX1Q8TCU6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PREX1Q8TCU6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PREX1Q8TCU6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PREX1Q8TCU6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PREX1Q8TCU6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PREX1Q8TCU6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms