Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PPFIBP2Q8ND30 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPFIBP2Q8ND30 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPFIBP2Q8ND30 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms