Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00337Q8N6G1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00337Q8N6G1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC00337Q8N6G1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms