Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMIM20Q8N5G0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMIM20Q8N5G0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMIM20Q8N5G0 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMIM20Q8N5G0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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