Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXA5

SPACA3, Sperm acrosome membrane-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA3Q8IXA5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPACA3Q8IXA5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SPACA3Q8IXA5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPACA3Q8IXA5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPACA3Q8IXA5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPACA3Q8IXA5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPACA3Q8IXA5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPACA3Q8IXA5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPACA3Q8IXA5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPACA3Q8IXA5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SPACA3Q8IXA5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms