Protein–RNA interactions for Protein: Q86XM0

CATSPERD, Cation channel sperm-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPERDQ86XM0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CATSPERDQ86XM0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPERDQ86XM0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPERDQ86XM0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPERDQ86XM0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CATSPERDQ86XM0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CATSPERDQ86XM0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CATSPERDQ86XM0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CATSPERDQ86XM0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CATSPERDQ86XM0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms