Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PPFIBP1Q86W92 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PPFIBP1Q86W92 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PPFIBP1Q86W92 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPFIBP1Q86W92 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms