Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDXQ7Z353 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDXQ7Z353 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HDXQ7Z353 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HDXQ7Z353 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HDXQ7Z353 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HDXQ7Z353 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HDXQ7Z353 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HDXQ7Z353 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDXQ7Z353 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDXQ7Z353 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HDXQ7Z353 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms