Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT6

SSX6, Putative protein SSX6, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX6Q7RTT6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SSX6Q7RTT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SSX6Q7RTT6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SSX6Q7RTT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SSX6Q7RTT6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms