Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQX7

LIAT1, Protein LIAT1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIAT1Q6ZQX7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LIAT1Q6ZQX7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LIAT1Q6ZQX7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LIAT1Q6ZQX7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LIAT1Q6ZQX7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms