Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI25

CNIH2, Protein cornichon homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH2Q6PI25 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
CNIH2Q6PI25 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CNIH2Q6PI25 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNIH2Q6PI25 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CNIH2Q6PI25 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH2Q6PI25 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH2Q6PI25 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNIH2Q6PI25 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms