Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC18B1Q6NT16 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18B1Q6NT16 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18B1Q6NT16 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18B1Q6NT16 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms