Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT79Q5XKE5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT79Q5XKE5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT79Q5XKE5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT79Q5XKE5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KRT79Q5XKE5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT79Q5XKE5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT79Q5XKE5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT79Q5XKE5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms