Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LCN1P1Q5VSP4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCN1P1Q5VSP4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LCN1P1Q5VSP4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
LCN1P1Q5VSP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms