Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS37

NHLRC3, NHL repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC3Q5JS37 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NHLRC3Q5JS37 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NHLRC3Q5JS37 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NHLRC3Q5JS37 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NHLRC3Q5JS37 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms