Protein–RNA interactions for Protein: Q562F6

SGO2, Shugoshin 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO2Q562F6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SGO2Q562F6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SGO2Q562F6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SGO2Q562F6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SGO2Q562F6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms