Protein–RNA interactions for Protein: Q53SF7

COBLL1, Cordon-bleu protein-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COBLL1Q53SF7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
COBLL1Q53SF7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
COBLL1Q53SF7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
COBLL1Q53SF7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
COBLL1Q53SF7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
COBLL1Q53SF7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms